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技術(shù)文章

ctDNA提取試劑盒對血漿樣本長(cháng)期儲存穩定性影響的實(shí)驗研究

技術(shù)文章
  循環(huán)腫瘤DNA是來(lái)源于腫瘤細胞并釋放到血液中的核酸片段,因其具有非侵入性、實(shí)時(shí)反映腫瘤基因狀態(tài)等特性,在腫瘤早期診斷、療效監測及預后評估等方面展現出巨大潛力。然而,血漿樣本的長(cháng)期儲存可能導致ctDNA降解或損失,因此,選擇能有效保持ctDNA穩定性的提取試劑盒至關(guān)重要。
 
  一、實(shí)驗方法與材料:
 
  本研究選取了市售主流的五種ctDNA提取試劑盒,并收集了一批來(lái)自不同腫瘤類(lèi)型的患者新鮮血漿樣本,按照標準操作程序進(jìn)行處理后,將其分為短、中、長(cháng)期(如1個(gè)月、3個(gè)月、6個(gè)月、12個(gè)月)四個(gè)時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行冷凍保存。各時(shí)間點(diǎn)分別使用選定的試劑盒進(jìn)行ctDNA提取,通過(guò)qPCR、ddPCR等技術(shù)檢測特定腫瘤相關(guān)突變基因的豐度。
 
  二、實(shí)驗結果與分析:
 
  實(shí)驗結果顯示,所有試劑盒在短期儲存血漿樣本中均能有效提取ctDNA,但在長(cháng)期儲存條件下,部分試劑盒表現出優(yōu)異的性能,能夠保持ctDNA完整性,其提取效率僅輕微下降或無(wú)顯著(zhù)變化。對比分析表明,含有特殊保護劑以及優(yōu)化的裂解、純化步驟的試劑盒,在長(cháng)期儲存樣本中ctDNA的穩定性和提取效果更佳。
 

 

  ctDNA提取試劑盒的選擇對于確保血漿樣本長(cháng)期儲存后的ctDNA穩定性具有直接影響。本研究揭示了某些ctDNA提取試劑盒在應對血漿樣本長(cháng)期儲存挑戰時(shí)所具備的優(yōu)勢,有助于指導未來(lái)臨床實(shí)踐和科研工作中ctDNA檢測方案的設計與實(shí)施。此外,為進(jìn)一步提升ctDNA長(cháng)期儲存的穩定性,有必要繼續研發(fā)針對性更強、效果更優(yōu)的提取技術(shù)和試劑盒產(chǎn)品。
 
  后續研究可進(jìn)一步探究血漿樣本儲存條件(如溫度、凍融次數等)與ctDNA穩定性之間的具體關(guān)系,并結合生物信息學(xué)手段對提取出的ctDNA質(zhì)量進(jìn)行深度評價(jià),以推動(dòng)ctDNA作為液體活檢標志物在精準醫療領(lǐng)域更為廣泛而精確的應用。
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